Juara I Widya Mandala Accounting Games

Setiap tahun, Universitas Katolik Widya Mandala, Surabaya, selalu mengadakan lomba akuntansi untuk siswa tingkat SMA se-Jawa Timur. Untuk tahun ini, lomba diadakan pada hari Sabtu, tanggal 14 Maret 2009. Para peserta berdatangan dari berbagai daerah di Jawa Timur untuk mengikuti lomba ini. Mereka membawa misi masing-masing, datang untuk menang. Untuk mewujudkan impian itu, pasti setiap peserta yang datang sudah menyiapkan diri dengan sebaik-baiknya. Namun, sekalipun mereka sudah menyiapkan dengan baik, hanya peserta yang terbaiklah yang akan memperoleh kemenangan.

Pada kompetisi ini, SMA Kristen Petra 3 mengirimkan tiga tim. Setelah melewati beberapa babak yang mendebarkan, akhirnya salah satu tim berhasil menjadi yang terbaik dengan membawa trofi Juara I. Bagi pemenang, panitia menyediakan uang pembinaan dan memberikan beasiswa berupa bebas uang sumbangan pendidikan (USP) bagi siswa yang akan melanjutkan kuliah di sana. Peraih juara itu adalah Yan Christianto, Ketut Mira, dan Evelina Larisa.

Juara I Lomba Cosplay

Pada hari Minggu, tanggal 15 Maret 2009, Universitas Brawijaya, Malang, mengadakan Lomba Isshoni Tanoshimimasou IV se-Jawa Timur, yang diselenggarakan oleh Jurusan Bahasa dan Sastra Jepang. Pada lomba ini, SMA Kristen Petra 3 mengirimkan Christin Ana Wijaya (XIS-2) untuk menjadi salah satu peserta. Akhirnya dia berhasil meraih Juara I dalam lomba cosplay, dengan karakter Enma Ai, dari anime Jigoku Shoujo. Dia tampil lengkap dengan peralatannya yang khas, yaitu pisau berdarah dan boneka voodoo, dengan wajah putih pucat, berdarah-darah khas hantu Jepang, serta kimono hitam menyentuh lantai. Cosplay adalah lomba meniru karakter suatu anime, dengan dandanan dan gayanya yang khas.

Juara I Lomba Akuntansi

Pada hari Jumat, tanggal 3 April 2009, Universitas Kristen Satya Wacana, Salatiga, Jawa Tengah, mengadakan Lomba Akuntansi tingkat SMA/SMK se-Jawa. Pada Kompetisi ini, SMA Kristen Petra 3 mengirimkan satu tim dengan seorang guru pembina. Mereka adalah Yan Christianto, Zendy Wiranata, dan Evelina Larisa, sedangkan guru pembinanya adalah Ibu Lanny Tononuwu, S.E. Setelah mengikuti beberapa babak, akhirnya tim ini berhasil merebut Juara I. Diharapkan dengan adanya lomba ini, para siswa lainnya terpacu untuk meningkatkan prestasi di bidang lainnya.

Olimpiade Sains Nasional (OSN 2009)  

Mulai tanggal 3—9 Agustus 2009, Yan Christianto Setiawan (XIIS-2) mengikuti Olimpiade Sains Nasional bidang Ekonomi di Jakarta. Olimpiade yang diadakan secara rutin setiap tahun ini, diikuti oleh perwakilan siswa tingkat SMA se-Indonesia. Ia akhirnya berhasil meraih medali perak.